¿Cómo desactivo la ubicación simulada?
Detén la simulación con el botón de la aplicación: las coordenadas vuelven a ser reales al instante. Para quitar del todo la posibilidad de simular, vuelve a poner «Elegir aplicación para simular ubicación» en «Ninguna» en las opciones para desarrolladores.
Hay tres niveles de desactivación, y conviene elegir según lo que quieras conseguir.
El primero es detener la simulación actual. Toca el botón de simulación en la aplicación: se apaga, la notificación permanente desaparece del panel y el sistema vuelve a las coordenadas reales. La aplicación sigue elegida en los ajustes, y para el siguiente inicio basta un toque en el mapa.
El segundo es quitarle a la aplicación el papel de fuente. Ajustes → «Opciones para desarrolladores» → «Elegir aplicación para simular ubicación» → «Ninguna». Después, la simulación no se iniciará aunque la aplicación esté abierta: el sistema ya no acepta coordenadas de ella. Es lo que necesitas si dejas el teléfono a otra persona o si una aplicación comprueba si quedan coordenadas simuladas.
El tercero es desactivar el propio modo desarrollador. Ajustes → «Opciones para desarrolladores» → el interruptor de la parte superior de la pantalla. La sección desaparece por completo de los ajustes; puedes recuperarla con los mismos siete toques en el número de compilación. No hace falta desinstalar la aplicación para esto.
Si otra aplicación sigue mostrando el punto simulado después de detener la simulación, simplemente guarda en memoria la última coordenada conocida: ciérrala por completo y vuelve a abrirla. Este caso se explica en la pregunta las coordenadas se quedaron tras detenerla.