Qual a diferença entre a versão da RuStore e o APK do site?
Os recursos de simulação de localização são os mesmos. Há uma diferença: a versão do site consegue baixar e instalar atualizações sozinha, e a versão da RuStore só é atualizada pela RuStore — são as regras da loja.
A versão da RuStore fisicamente não contém o código de autoatualização, em vez de tê-lo desligado por uma configuração: a loja proíbe que apps publicados baixem e instalem APKs por conta própria, contornando a loja, por isso essa versão nem pede a permissão correspondente.
As duas versões têm assinaturas diferentes, e isso tem uma consequência prática: o Android não deixa instalar uma sobre a outra — o sistema recusa com um erro de atualização incompatível. Para trocar a versão da RuStore pela do site ou vice-versa, desinstale o app primeiro. Seus locais e histórico não se perdem se você estiver conectado à conta: eles voltam pela sincronização depois que você entrar.
Qual escolher: a RuStore é mais prática se você quer que as atualizações cheguem do jeito habitual, junto com seus outros apps. A versão do site é atualizada mais rápido — uma nova versão fica disponível logo após ser publicada, sem esperar a revisão da loja.