Mock Locationアカウントなしで保存した場所は、後でログインするとどうなりますか？
黙って上書きされることはありません。端末のデータとアカウントのデータが異なる場合、アプリが同期の方向を尋ねます。
選択肢は 2 つです。端末の場所をアカウントに送るか、逆にサーバーにすでに保存されているものをスマートフォンに取り込むかです。選ぶのはあなたで、アプリは勝手に決めずに、選択肢をはっきり表示します。
これは 2 台目のスマートフォンにアプリをインストールする場合に重要です。そこでは端末のリストは通常空なので、「サーバーからスマートフォンへ」の方向で同期する必要があります。