Чем версия из RuStore отличается от APK с сайта?
Функции подмены геолокации одинаковые. Отличие одно: версия с сайта умеет сама скачивать и ставить обновления, а версия из RuStore обновляется только через сам RuStore — таковы его правила.
В сборке для RuStore код автообновления отсутствует физически, а не отключён настройкой: магазин запрещает публикуемым приложениям самостоятельно загружать и устанавливать APK в обход магазина, поэтому соответствующее разрешение в этой сборке не запрашивается вовсе.
У двух сборок разные подписи, и это имеет практическое следствие: поставить одну поверх другой Android не даст — система откажет с ошибкой несовместимости обновления. Чтобы перейти с версии RuStore на версию с сайта или обратно, приложение нужно сначала удалить. Места и история при этом не пропадут, если вы вошли в аккаунт: они восстановятся из синхронизации после входа.
Что выбрать: RuStore удобнее, если вы хотите, чтобы обновления приходили привычным образом вместе с остальными приложениями. Версия с сайта обновляется быстрее — новая сборка доступна сразу после публикации, без ожидания модерации магазина.